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1.1 操作流程
接種細胞:3×104 /孔 藥物刺激 一般作用24 小時,上機
1.2 方法
在cellquest 環(huán)境下,利用control 細胞標定上樣條件,并在已設(shè)好的文件
夾(INS 文件及SET 文件)下,保存好需要的上樣文件 關(guān)閉cellqest 軟件,
打開MPM 軟件 在MPM 軟件下進行一系列設(shè)定(首先在Autosample 下,
進行SettingInitial 及FinalWashing 操作,清洗整個管路 管路清洗完畢進行
上樣條件設(shè)定(主要設(shè)定上樣體積(一般100ul),混合體積(一般100ul),混合次數(shù),
清洗次數(shù)等,在Acquisition 菜單下設(shè)定current plate(現(xiàn)在使用的板號是353263),
DateStorageFolder( 即數(shù)據(jù)儲存文件夾) , AcquisitionDocument 及
InstrumentSettingsFile(上樣條件從保存好的INS 及SET 文件中選定) 上樣
條件設(shè)定完畢,選定96 孔板的上樣范圍 在Acquisition 下選擇Acquire,
上樣 上樣完畢,退出上樣板,使用次**鈉及水,清洗管路(將次**鈉
及水加在96 孔板上,以上樣的方式清洗管路)
*須知:如果使用PBS 作為上樣鞘液,上樣完畢后,換用水作為鞘液,并反復沖
洗管路,防止PBS 鹽結(jié)晶堵塞管路。
1.3 注釋
1) 必需的control:應準備一管對于檢測指標為陰性的細胞(例如:若要檢測
Jurkat-NF-KB-GFP 經(jīng)藥物刺激樣本,就需要準備一管Jurkat 細胞(GFP 為陰
性)),用于標定機器的上樣條件。細胞量為1×106 個/ml,1ml。
2) 上機前,應對樣本進行混合,以使樣本均一(注意使用排槍吹打,勿產(chǎn)生氣泡)。
3) 以上protocol 僅針對于懸浮細胞。
4) 藥物刺激濃度需先做梯度檢測。
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
42
2. Cell Cycle Assay
常用的實驗細胞株包括:293(T),MCF7,U2OS,Saos,Hela 等
以U2OS 細胞為例
2.1 細胞培養(yǎng)及鋪板
1) 細胞株及材料:
a) 細胞株: U2OS 細胞
b) 培養(yǎng)基: DMEM(10%FBS,GBICO),DMEM(無血清)
c) 培養(yǎng)器皿:75cm2 培養(yǎng)瓶,6cm 培養(yǎng)皿
2) 細胞培養(yǎng)及鋪板:
a) 傳代:用DMEM(10%FBS) 培養(yǎng)基接種U2OS 至75cm2 培養(yǎng)瓶,細胞長
滿后鋪板并傳代。
注:一般一瓶細胞總數(shù)可以達到1×107 個
b) 鋪板:
細胞消化:將培養(yǎng)好的U2OS 細胞,傾去培養(yǎng)基,加入2ml 1×胰酶輕輕
搖晃以覆蓋整瓶細胞,37℃培養(yǎng)箱放置2-3min,觀察細胞從
瓶壁上脫落下來(也可以用手拍擊瓶壁),顯微鏡下觀測到細胞
成單個,或是只有2-3 個細胞聚團,即可以加入5ml 含有血清
的DMEM(10%FBS),終止胰酶的消化作用。
細胞計數(shù):如果細胞密度較大,可按一定倍數(shù)稀釋后計數(shù)。
細胞密度(單位:個/ml)=(4 個大方格的細胞總數(shù)/4)×104×稀釋倍數(shù)
鋪板: 6cm培養(yǎng)皿按照每孔6×105 個細胞(即1.5×105/ml,4ml)
細胞加入后將6cm 培養(yǎng)皿沿水平面桌面的方向前后左右來回晃動
(手勢一定要輕柔,防止培養(yǎng)液潑出),使細胞能夠均勻分布,放置細
胞培養(yǎng)箱生長。
注:計算鋪板量時,應將control 板,藥物陽性對照板及質(zhì)粒對照板考慮在內(nèi)。
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
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2.2 轉(zhuǎn)染
1) 試劑及材料:
a) 轉(zhuǎn)染試劑:Lipofectamin 2000
b) 質(zhì)粒:對照質(zhì)粒:pEF-BOS
p21(陽性對照)
p16(陽性對照)
GFP-spectin
目的基因質(zhì)粒,構(gòu)建在pEF-FN 載體上
注:若目的基因載體不是pEF-FN,則對應的空載體要相應變化。
2) 轉(zhuǎn)染:細胞密度為50%-60%時,進行轉(zhuǎn)染
A:0.3μg GFP-spectin+3μg interest gene+ serum free DMEM 至終體積500μl/
孔。
B:9.9μL lipofectamine 2000+490.1μL serum free DMEM 體積為500μl /孔,室
溫放置5min
A,B 二者混合,室溫放置20-30min 后將混合液緩慢而均勻的加到6cm 板
細胞液中,每板為1000μL,輕輕搖晃,使DNA 分布均勻,轉(zhuǎn)染5 小時后,
換置培養(yǎng)液(10%FBS+DMEM)。
2.3 細胞分板
細胞分板:轉(zhuǎn)染12-16 小時后, 根據(jù)細胞密度按1:3 或1:2 分板,使分
板后細胞密度為30%左右,37℃繼續(xù)培養(yǎng)30h。
2.4 加藥刺激
除了利用轉(zhuǎn)染質(zhì)粒作為陽性對照,也可使用藥物處理細胞作為陽性對照樣本
細胞鋪板24 小時后,加藥刺激:
G1,S-arrest :L-mimosine: 0.5mM
5-fluorourcil: 10mM
G2/M arrest : nocodazole: 50ng/ml
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
44
加藥后,繼續(xù)培養(yǎng)24 小時
附注:作為陽性對照的基因及藥物的具體使用情況見附表1。
2.5 細胞收獲及處理
分別收集培養(yǎng)液,在每個6cm 板中加入1ml 胰酶消化(細胞消化的方法同上)。
消化完畢,加入已收集的培養(yǎng)液(注意一一對應,防止弄錯)中和胰酶。離心(300g,
5min)收集細胞,棄上清,加入2-3ml 75%乙醇(細胞量較多,可酌量多加),votex,
充分混勻,放入-20oC 冰箱,保存。
2.6 上機樣本制備
從-20oC 取出細胞樣本(至少已在-20oC 放置4 小時),離心(300g,5min)收集細
胞,棄上清。1×PBS 清洗兩遍,加入100ul 1×PBS,votex 混勻,加入10ulPI(終
濃度100ug/ml),10ulRnase(終濃度50ug/ml),置于37oC 水浴鍋,避光處理30min。
注:細胞量較多時,PI 及RNase 量應酌量增加。
2.7 上機
在cellquest 環(huán)境下,選擇FL-1(GFP)及FL-3(PI)作為研究對象,先上control
樣本標定上樣條件,進而上其他樣本。
2.8 相關(guān)試劑的配制
1.1×PBS:采用GIBCO 1×10L D’PBS(Cat.No21600-069)配制。
2.PI:以水為溶劑,母液濃度為1mg/ml,配制完畢后,4oC 避光保存
3.Rnase:以水為溶劑,母液濃度為0.5mg/ml,配制完畢后,分裝凍存于-20oC
4.L-mimosine: 以無血清培養(yǎng)液為溶劑,母液濃度為100mM,配制完畢后,
4oC 避光保存
5.5-fluorourcil:以DMSO 為溶劑,母液濃度為549mM,配制完畢后,4oC 保
存
6.Nocodazole:以DMSO 為溶劑,母液濃度為5mg/ml,配制完畢后,4oC 保存
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
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附表1:陽性對照基因及藥物
3.FACS analysis on Apoptosis
可用于凋亡檢測的細胞,多為對細胞凋亡較為敏感的細胞,例如:MCF7, Hela
以Hela 細胞為例
3.1 細胞培養(yǎng)及鋪板
1) 細胞株及材料:
i. 細胞株: Hela 細胞
ii. 培養(yǎng)基: DMEM(10%FBS GBICO),DMEM(無血清)
iii. 培養(yǎng)器皿:75cm2 培養(yǎng)瓶,6cm 培養(yǎng)皿
2) 細胞培養(yǎng)及鋪板:
a) 傳代:用DMEM(10%FBS) 培養(yǎng)基接種hela 細胞至75cm2 培養(yǎng)瓶,細胞
長滿后鋪板并傳代。
注:一般一瓶細胞總數(shù)可以達到3×107 個
b) 鋪板:
i.細胞消化:將培養(yǎng)好的Hela 細胞,傾去培養(yǎng)基,加入2ml 1×胰酶輕
輕搖晃以覆蓋整瓶細胞,37℃培養(yǎng)箱放置2-3min,觀察細
胞從瓶壁上脫落下來(也可以用手拍擊瓶壁),顯微鏡下觀測
基因 藥物
G0/G1 P21,P16 L-mimosine: 0.5mM
S 5-fluorourcil: 10mM
G2/M nocodazole: 50ng/ml
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
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到細胞成單個,或是只有2-3 個細胞聚團,即可以加入5ml
含有血清的DMEM(10%FBS),終止胰酶的消化作用。
ii.細胞計數(shù):如果細胞密度較大,可按一定倍數(shù)稀釋后計數(shù)。
細胞密度(單位:個/ml)=(4 個大方格的細胞總數(shù)/4)×104×稀釋倍數(shù)
iii.鋪板: 6cm 培養(yǎng)皿按照每孔3×105 個細胞(即0.75×105/ml,4ml)接種,
細胞加入后將6cm 板沿水平面桌面的方向前后左右來回晃動(手勢一定
要輕柔,防止培養(yǎng)液潑出),使細胞能夠均勻分布,放置細胞培養(yǎng)箱生長。
注:計算鋪板量時,應將control 板,藥物陽性對照板及質(zhì)粒對照板考慮在內(nèi)。
3.2 轉(zhuǎn)染
1)試劑及材料:
轉(zhuǎn)染試劑:Lipofectamin 2000
質(zhì)粒: a:對照質(zhì)粒:pEF-BOS
RIP(陽性對照)
b:GFP-spectin
c:目的基因質(zhì)粒,構(gòu)建在pEF-FN 載體上
注:若目的基因載體不是pEF-FN,則對應的空載體要相應變化。
2)轉(zhuǎn)染:細胞密度為50%-60%時,進行轉(zhuǎn)染
A:0.15μg GFP-spectin+3μg interest gene+ serum free DMEM 至終體積500μl/孔。
B:9.45μL lipofectamine 2000+490.55μL serum free DMEM 體積為500μl /孔,室
溫放置5min
A, B 二者混合,室溫放置20-30min 后將混合液緩慢而均勻的加到6cm 培養(yǎng)皿
中,每孔為1000μL,輕輕搖晃,使DNA 分布均勻,轉(zhuǎn)染5 小時后,換置培養(yǎng)
液(10%FBS+DMEM)。繼續(xù)培養(yǎng)
3.3 細胞收獲
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
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轉(zhuǎn)染24 小時后,一旦觀察到經(jīng)RIP 轉(zhuǎn)染的細胞明顯死亡,即可收獲細胞。
每板分別收集培養(yǎng)液,在每個6cm 板中加入1ml 胰酶(細胞消化的方法同上),
消化完畢,加入已收集的培養(yǎng)液(注意一一對應,防止弄錯)中和胰酶,離心(300g,
5min)收集細胞。
3.4 上機樣本制備
收集細胞液(包括上清) 同時準備56℃水浴處理細胞
分別取一點
沒有轉(zhuǎn)染的細胞
作為control
及轉(zhuǎn)染的細胞
作為GFP 單染樣本 PBS 洗
染AnnexinV Ab-PE 染7-AAD
室溫避光15min
PE-mouse IgG 室溫避光染色15min
1╳binding buffer 洗兩次
染7-AAD,室溫避光15min AnnexinV Ab-PE/ 7-AAD 染色,室溫避光15min
3.5 上機
在cellquest 環(huán)境下,選擇FL-1(GFP),F(xiàn)L-2(PE)及FL-3(7-AAD)作為研究對
象,先上control 樣本標定電壓,域值,再用單染GFP 的細胞樣本及水浴處理后
單染PE,7-AAD 的樣本,調(diào)節(jié)補償,*終確立上樣條件,進而上其他樣本。
注:A:用GFP 單染樣本以及水浴處理的單標Annexin V-PE 樣本調(diào)節(jié)FL1-H 及
FL2-H 的補償;
B:水浴處理的單標Annexin V-PE 以及水浴處理的單標7-AAD 樣本調(diào)節(jié)
FL2-H 及FL3-H 的補償。
4. CD69 檢測
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
48
(或其他類似的免疫熒光檢測)
4.1 細胞培養(yǎng)
1)細胞株及材料:
細胞株:Jurkat-T 細胞或Jurkat 細胞
培養(yǎng)基:RPMI 1640(10%FBS GBICO;1%雙抗),RPMI 1640(無血清)
培養(yǎng)器皿:75cm2 培養(yǎng)瓶;175cm2 培養(yǎng)瓶;25 cm2 培養(yǎng)瓶;96 孔細胞培養(yǎng)板
2)Jurkat-T 細胞的培養(yǎng):
Jurkat-T 細胞為懸浮細胞,細胞活力好時,鏡檢多為10 個左右細胞聚團,
及少量游離的單個細胞,細胞圓而透亮。一般培養(yǎng)按密度來計算,起始培養(yǎng)
密度不要低于1×105 個/ml,24hr 后細胞密度即可達到2×105 個/ml,以此類推
在第五天上即可以達到1.6×106 個/ml,根據(jù)這個來調(diào)整接種密度及傳代天數(shù)。
細胞的密度高不能超過1.6×106 個/ml。
例如,起始培養(yǎng)密度2×105 個/ml,體積30 ml,在第三天時, 細胞密度
達到8×105 個/ml,細胞總數(shù)達到2.4×107 個,因為檢測一個待檢基因的電擊
所需細胞數(shù)量為1×107 個,所以,此培養(yǎng)的細胞數(shù)只能做2.4 個樣品,因此,
根據(jù)實驗所需要檢測的樣品數(shù)目來調(diào)整培養(yǎng)細胞的體積(象175cm2 的培養(yǎng)瓶
可以培養(yǎng)200-300ml 細胞懸液,細胞總數(shù)可以達到16-24×107,這樣就可以做
16-24 個樣品)。
4.2 電擊轉(zhuǎn)化
細胞總數(shù)達到檢測樣品所需則可轉(zhuǎn)染(細胞密度在1×106/ml 左右)。
轉(zhuǎn)染用品:電擊儀,400mm 電擊杯
質(zhì)粒: a:對照質(zhì)粒:NFAT 刺激系統(tǒng):negative control:pEF-BOS
positive control: SYC plasmid
NFAT 抑制系統(tǒng): negative control:pEF-BOS
positive control: SLIM plasmid
b: NFAT-luc report plasmid
c:目的基因質(zhì)粒,構(gòu)建在pEF-FN 載體上
試劑: 臺盼藍(0.4%)
1)將Jurkat-T 細胞轉(zhuǎn)到50ml 離心管中,細胞計數(shù)(細胞密度在1×106 左右)。
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
49
2)1000rpm離心,用無血清的RPMI1640 培養(yǎng)液收集細胞,調(diào)整濃度為2.5×107/mL,
每個電極杯中加入400μl 細胞液(細胞總數(shù)為1×107 個)。
3)依次加入10μg NFAT-luc reporter gene 和20ug interest gene(體積控制在20μl 以
內(nèi)),使質(zhì)粒和細胞混勻(盡量不要產(chǎn)生氣泡)。
4)電擊條件250V,950μF。電擊前輕輕彈擊電擊杯,將杯底的細胞重懸起來,注
意不要產(chǎn)生氣泡。電擊時觀察一下time constant(約為24ms)。
5)電擊完后立即彈擊電擊杯的側(cè)壁使細胞混勻,室溫下放置30min。
6)將電極杯中的細胞加到10mL RPMI1640 培養(yǎng)液中(含serum)24cm2 培養(yǎng)瓶,培
養(yǎng)40hr(即培養(yǎng)到第三天上午)。
4.3 鋪板,加藥
C305:1∶60 稀釋使用
PMA: 儲存濃度為0.5mg/ml,應用濃度為50ng/ml(稀釋10000 倍))
Ionomycin: 儲存濃度為1mM,應用濃度為1μM(稀釋1000 倍));
1)將轉(zhuǎn)染培養(yǎng)40hr 后的細胞轉(zhuǎn)到15ml 離心管中,進行活細胞計數(shù)(臺盼藍染色),
離心收細胞,調(diào)整細胞濃度為2×106/ml。
2)在96 孔板中,每孔加50μL 細胞(細胞數(shù)為1×105),每個樣品還是要做3 個復
孔。NFAT 刺激系統(tǒng),NFAT 抑制系統(tǒng)可以同時進行,前者無需加藥刺激,后
者需要做C305 抗體刺激和PMA+ Ionomycin 刺激,因此,一個樣品需要做9
個復孔。按順序在96 孔板中加入細胞,并相應做好標記。
3) 對于NFAT 刺激系統(tǒng),直接在每孔中補加50μl 新鮮培養(yǎng)基,使終體積為100μl;
對于NFAT 抑制系統(tǒng)分別加入50μL C305(anti-TCR, 60 倍稀釋);或50μl
PMA(50ng/mL)+Ionomycin(1μM),刺激8-12 小時。
4.4 細胞收獲及處理
將刺激8-12 小時后的細胞取出,離心收集細胞
4.5 樣本制備
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
50
A:CD69 間標法
Cells harvested
1 × PBS 清洗兩遍
Cells were suspended in 1ml 1×binding buffer (1% BSA)
(cell 濃度約1×106/ml)
取其中的100μl
5μl pure-Mouse IgG1 5μl Mouse anti-human CD69 (或其它一抗)
(非特異性染色)
4oC 或冰上放置, 30min
1×binding buffer (1% BSA) 清洗兩遍(每次4ml)
5μl PE goat anti-mouse IgG 及 5μl 7-AAD
4oC 或冰上,避光放置15min
1×PBS 清洗兩遍(每次2ml)
上機
B:CD69 檢測直標法
操作步驟基本同間標法,只是作非特意性對照的樣本,直接用Mouse
anti-human IgG-pe 直接標記
4.6 上機
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
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在cellquest 環(huán)境下,選擇FL-1(GFP),F(xiàn)L-2(PE)及FL-3(7-AAD)作為研究對
象,先上control 樣本標定電壓,閾值,并調(diào)節(jié)補償,*終確立上樣條件,進而
上其他樣本。
4.7 幾種藥物的儲存濃度和應用濃度
TNF 1×106U/瓶 1mg=4×107U, 1×106U=25μg 溶于12.5mL PBS 中,濃度為
2μg/mL。
儲存濃度:2μg/mL
應用濃度:20ng/mL(稀釋100 倍)
C305 60 倍稀釋使用。
PMA and Ionomycin(dissolved in DMSO)
PMA:1 支1mg 溶于2ml DMSO 即0.5mg/mL(儲存于-80°C)
儲存濃度:0.5mg/ml
應用濃度:50ng/ml(稀釋10000 倍)
Ionomycin: 1mg/747.1(MW)=1.33×10-3mmol 溶于1.33ml,濃度為1mM。(儲存與
-80°C)
儲存濃度:1mM
應用濃度:1μM(稀釋1000 倍)
5. 細胞分選
5.1 分選細胞樣本處理
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
52
貼壁細胞培養(yǎng):一個細胞樣本 懸浮細胞培養(yǎng):一個細胞樣本
至少需要一個10cm 細胞板 細胞總數(shù)應大于1×107
(細胞總數(shù)大于1×107 )
收集細胞
去除培養(yǎng)液
胰酶消化(一般加入2ml 胰酶,
37 oC 充分消化,大約3 分鐘,
消化至細胞輕拍脫壁)
加入5ml 培養(yǎng)液中和,充分
分散細胞(盡量使之呈單
細胞懸液,可通過顯微鏡觀察判斷)
取100ul 細胞上機,測定轉(zhuǎn)染效率,剩余細胞記數(shù),離心
根據(jù)轉(zhuǎn)染效率,分選模式(一般選用exclusion 模式),調(diào)節(jié)細胞濃度,達到
上樣速率1000-3000 個/秒,目的細胞300 個/秒(細胞濃度(個/ul)=300/目的
細胞百分率)
上機,分選
分選后細胞,1500 轉(zhuǎn)/秒,5min,離心收集細胞
1) 若所要分選的是懸浮細胞,要求細胞總數(shù)大于1×107,直接收集細胞液
2) 必需的control:舉例說明,如果需要篩選的是GFP 陽性的細胞,必須提供沒
有轉(zhuǎn)染的同種細胞。
3) 如果分選后的細胞還需要繼續(xù)培養(yǎng),需要預先用無菌的4%BSA 包埋收集管
(在無菌收集管中,加滿4%BSA ,并放置于4℃至少1 小時,使用前倒除包
埋液)。
4) 如果分選后的細胞還需要繼續(xù)培養(yǎng),所有用到的試劑,包括鞘液,都必須無
菌處理;在分選前及分選過程中,必須進行嚴格無菌操作,機器需要經(jīng)過酒
精沖洗,無菌PBS 沖洗的過程。
5.2 分選細胞的上機操作程序
5.2.1 上機分選前準備
第七章 流式細胞分析分選術(shù)
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1)無菌分選
分選前夜FACS 儀器間需紫外照射過夜,收集管預先用4%BSA 包埋(4
℃至少1 小時) 分選前沖洗機器程序:1. 將上樣管換成75%酒精,鞘液
桶中換成3L 75%酒精沖洗,至3L 酒精完全跑完; 2. 倒去鞘液桶中殘余的酒精,
用無菌PBS 沖洗鞘液桶使酒精徹底去除,加無菌PBS 至鞘液桶滿,同時上樣管
中換成無菌PBS,沖洗,使每個收集管收集液體約20ml 左右,即可上機分選。
2)非無菌分選
如果不需要無菌分選,可僅用少量酒精沖洗,再用PBS 沖洗至每管收集約
20ml 后即可上機分選。
5.2.2 上機分選步驟
打開cellquest 軟件,先上control 樣本,確定細胞獲取條件,并劃定需要獲
取的細胞范圍;在Acquire menu 菜單下,選擇SortSetup,并設(shè)定SortSetup 下的
一系列參數(shù),設(shè)定完畢,Acquire,上樣分選。
注:SortSetup 下主要的參數(shù)設(shè)定如下:
SortGate 選擇分選門,SortCount 選擇0(連續(xù)分選),
SortMode 選擇分選模式(一般使用exclusion)
*須知:分選完畢后,用水沖洗,使每個收集管收集液體約20ml 左右后可停止(防
止分選管道中形成鹽結(jié)晶)。繼而用常規(guī)沖洗方法沖洗上樣管。
5.3 相關(guān)試劑的配制
1.4%BSA 溶液:使用1×PBS 作為溶劑,每100ml 1×PBS 中加入4gBSA,充分溶
解.
2.1×PBS 溶液:采用GIBCO 1×10L D’PBS(Cat.No21600-069)配制。 上海恒遠生物科技有限公司提供各種進口高端產(chǎn)品,提供免費代測服務,歡迎新老顧客咨詢。
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